Fue considerado un lugar sagrado, utilizado por los incas como centro de adoración, en sectores de Qenqo se realizaban ceremonias en honor al Sol, la Luna y otros. En el lugar se encuentra a su ingreso un anfiteatro semicircular con vestigios de nichos de gran tamaño que fueron utilizadas posiblemente para la colocación de momias. A la llegada de los españoles no pudieron destruir Qenqo por el hecho de estar formada en una sola roca que los incas trabajaron para sus propósitos y funciones que tendría Qenqo.
En el complejo de Qenqo se encuentra una sala dedicada al sacrificio de animales para ceremonias o presentación de eventos astronómicos y funerales. De tal manera que encontramos dentro de Qenqo una sala donde se realizaban los sacrificios por la presencia de una mesa labrada y canales donde discurre la sangre en forma de serpiente. A su lado podemos encontrar la conexión que se tendría con el mundo de los muertos que serían el Ukju Pacha.
Qenqo está dividido en varios sectores como son: La Sala de los Sacrificios de Qenqo, Intiwatana y Observatorio Astronómico, la Canaleta Zigzagueante, el Anfiteatro, etc.
Qenqo fue parte de una huaca importante denominada “Patallacta”, según algunos historiadores aquí se encontraba la momia del inca Pachacuteq el inca más importante del imperio inca.
